構(gòu)建載體最關(guān)鍵的一步就是設(shè)計引物引入酶切位點，一旦引物設(shè)計好，那接下來就非常簡單了，今天重點就來教教大家如何利用 snapgene 輕松獲得構(gòu)建載體所需的引物序列。

1. 打開軟件，選擇第一個（紅線標(biāo)記），然后輸入基因的 CCDS 序列（基因的 CCDS 序列可在 NCBI 數(shù)據(jù)庫中獲得）。

2.點擊 ok 后界面，圖中顯示的是會切割基因編碼序列的酶

3. 接下來點擊最上面的 Enzymes Noncutters，會顯示所有不會切割基因編碼序列的酶，這些酶都是我們可以用的，選酶的標(biāo)準(zhǔn)：要選擇不能切割目的基因序列并且質(zhì)粒上含有的酶，還有就是最好是實驗室有的酶。

4. 確定了可以用的酶后，接下來需要確定設(shè)計引物時用的這兩種酶，確定方法：這兩種酶最好不要鄰近，最好使用雙酶切有共同 buffer 的酶,兩個酶切位點最好不要是同尾酶（切下來的殘基不要互補），否則效果相當(dāng)于單酶切。

5. 確定了所要用的酶之后，接下來需要做的就是設(shè)計引物并引入酶切位點（注意：一定要看清楚載體上 promoter 的方向，將 CDS 正向插入到 promoter 后面）。

6. 點擊左下角的 sequence，然后拉取上游一部分基因本身的序列，拉取的時候會顯示拉取的堿基的個數(shù)以及 Tm 值，拉取到 Tm 值 55 度左右就可以（55 度以上最好）。

7. 然后點擊 primer——add primer，選擇 top strand。

8. 點擊 insertions，在 site 位置處選擇你準(zhǔn)備引入的酶，比如我要引入 EcoR I，那我就選擇它，然后點擊 insert，這樣我們就引入了該酶的酶切位點。

9. 接下來需要添加保護堿基，所有的酶的保護堿基都加三個，哪個堿基沒有要求,使 GC 含量及 Tm 值適中即可。

10. 這樣上游引物就設(shè)計好了，接下來需要檢測一下引物是否會形成發(fā)卡結(jié)構(gòu)，可以應(yīng)用OligoCalc，如果發(fā)現(xiàn)會形成發(fā)卡結(jié)構(gòu)，那就需要對引物序列做出一些調(diào)整，直到發(fā)卡結(jié)構(gòu)消失。

11. 接下來拉取基因的下游的一部分序列，用同樣的方法設(shè)計好下游引物，有一點需要注意的是，設(shè)計下游引物的時候選擇 bottom strand。

這樣構(gòu)建載體所需的引物就設(shè)計好了，怎么樣，是不是感覺其實也沒有那么難，接下來就可以構(gòu)建屬于你自己的載體了。

深圳安培生物科技有限公司，是一家具有核心的技術(shù)實力、壹流的經(jīng)營管理水平和完善的市場銷售體系的生物高科技企業(yè)。總部設(shè)在廣東，服務(wù)面向全國。安培生物集進口試劑、實驗室耗材銷售、技術(shù)服務(wù)與合約開發(fā)為一體的專業(yè)化高科技公司，旨在為生命科學(xué)的發(fā)展提供壹流的產(chǎn)品與服務(wù)。本公司建立了涵蓋分子生物學(xué)、細胞生物學(xué)、免疫學(xué)、信號傳導(dǎo)和神經(jīng)科學(xué)等領(lǐng)域的產(chǎn)品供應(yīng)線，在各個領(lǐng)域內(nèi)向用戶提供世界前沿水平和質(zhì)量穩(wěn)定的產(chǎn)品，安培生物致力于為廣大的科研機構(gòu)、高等院校等優(yōu)質(zhì)客戶提供優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品、技術(shù)支持與服務(wù)。